在線上教育的領域，科大不斷致力走在創新科技與教學法發展的最前沿。於2012年，科大與全球大規模開放在線課程（MOOC）平台Coursera合作，成為當時亞洲首批及大中華地區唯一一家向全球提供MOOC課程的大學。一年後，科大也加入了另一MOOC平台edX。

由於科大率先啟動線上學習，在2019新型冠狀病毒病疫情期間得以迅速應變。

另外，科大（廣州）所有教室均支持混合模式教學，能提升兩個校園合作。