在线上教育的领域，科大不断致力走在创新科技与教学法发展的最前沿。于2012年，科大与全球大规模开放在线课程（MOOC）平台Coursera合作，成为当时亚洲首批及大中华地区唯一一家向全球提供MOOC课程的大学。一年后，科大也加入了另一MOOC平台edX。

由于科大率先启动线上学习，在2019新型冠状病毒病疫情期间得以迅速应变。

另外，科大（广州）所有教室均支持混合模式教学，能提升两个校园合作。