科研基建
工學院設有全方位的設備和儀器，這些「硬件」為各種突破性實驗提供基礎，而學院教學人員的多元化專才、技能和遠見則擔當必不可少的軟件角色。軟硬兼備的配置可以持續策導相關科研項目取得佳績，締造能產生社會影響的成果。
聯合實驗室
- 香港科技大學 - AP環境科學健康與環境創新聯合實驗室
- 香港科技大學-博智林聯合研究院
- 香港科技大學 - 中國聯通智慧社會聯合實驗室
- 香港科技大學協同創新中心
- 香港科技大學–德國電信系統與媒體實驗室
- 香港科技大學–滴滴出行聯合實驗室
- 香港科技大學–大彊創新科技聯合實驗室
- 香港科技大學 ENVF-INA / LMA 聯合環境實驗室
- 香港科技大學佛山智能製造研究院
- 香港科技大學-香港生產力促進局工業人工智能與機器人聯合實驗室
- 香港科技大學—香港體育學院體育科技聯合中心
- 香港科技大學-華為聯合實驗室
- 香港科技大學 - 科勁國際可持續技術聯合實驗室
- 香港科技大學 – 港鐵聯合實驗室
- 香港科技大學—NAVER/LINE人工智能實驗室
- 香港科技大學-微眾銀行聯合實驗室
- 香港科技大學—小i機器人機器學習及認知推理聯合實驗室
- 香港科技大學-迅雷區塊鏈聯合實驗室
- 教育部─微軟重點實驗室
- 微信-香港科技大學人工智能聯合實驗室
國家重點實驗室
國家工程技術研究中心
- 國家重金屬污染防治工程技術研究中心 （香港分中心）
研究中心（香港）
- 智能晶片與系統研發中心
- 大數據生物智能實驗室
- 老齡科學研究中心
- 人工智能研究中心
- 顯示技術研究中心
- 集成微系統研究中心
- 醫學成像與影像分析研究中心
- 智能傳感器與環境技術中心
- 斜坡安全中心
- 無線資訊科技中心
- 電子封裝實驗室
- 香港智能建造研發中心
- 芯片設計研究中心
- 智能自動駕駛中心
- 賽馬會對流與降水創科實驗室
- 賽馬會數據科學基礎創科實驗室
- 光子學科技中心
- 智能製造中心
- 體育科學與技術研究中心
- 水技術中心
研究中心（南沙）
- 建築物能源研究中心
- 工程材料及可靠性研究中心
- 高分子成型過程及系統中心
- 數字生活研究中心
- 創新污水處理技術中心